作为古代东西方经济文化交流主要通道和枢纽的新疆，其基督教发展史可追溯到7世纪到14世纪，当时“聂斯脱利派”在当地盛行，也就是今天人们常听到的“景教”，后逐渐衰落。1896年，随着西方传教士来华宣教的热潮，英国传教士将福音再次传入新疆。1946年2月24日，在中国籍的“内地会”牧师李开焕和程明霞夫妇的推动下，在迪化明德路1号土木结构平房院落内，“新疆中华基督教会”正式成立，这便是而今的全疆最大、信徒最多的乌鲁木齐明德路基督教堂的前身。

所谓“新疆中华基督教会”，八个大字涵盖了其全部的性质与宗旨：“新疆”说明了该会活动的区域；“中华”说明了该会是中国人“自立、自养、自传”的教会；“基督”说明该会的信仰基督，各组织教派在主内求同存异，摒弃异端；“教会”说明该会是在主内融为一体的团体，主耶稣基督是元首，弟兄姐妹互为肢体，在爱中建立自己。为了强调该会的办教原则，李开焕特意在教会院子里竖立木排书“自立、自养、自传”六个醒目大字。

随着中华基督教会的成立，玛纳斯、呼图壁、米泉、阜康、奇台、哈密、伊犁、塔城、阿克苏等地都与乌鲁木齐教会联系，挂出“新疆中华基督教分会”的牌子。

1959年后，新疆实行宗教制度民主改革和私房改造，新疆许多教会逐渐停止活动，一些地方的教会转入家庭教会。新疆中华基督教会将聚会点改在苏春华等信徒家中进行聚会。1966至1976年，文化大革命时期，全疆宗教活动基本停止。一些信仰纯正的基督徒仍坚持在家聚会，后来发展到近十个。乌鲁木齐基督教会的2堂16点，就是由此时的家庭教会发展起来的。

1985年，明德路大院归还给新疆中华基督教会，通过政府协调，由原来占用明德路1号大院的电子研究站为教会补偿修建一幢400平方米的两层楼房，作为新的礼拜堂。1985年8月25日礼拜堂完工并正式启用，并更名为乌鲁木齐市中华基督教会。仍以“自治、自养、自传”为办教原则。

随着信徒日益增加，原来的礼拜堂已经不能容纳。经过相关政府部门的批准，乌鲁木齐中华基督教会1994年10月开始修建新堂，1995年12月圣诞节前正式落成启用，且正式被命名为乌鲁木齐市基督教会明德路堂。教堂总建筑面积2400平方米，楼高七层，可以同时容纳两千余人聚会。