12月13日下午，南京市基督教两会于圣训堂举行了国家公祭日和平祈祷崇拜，南京市教会12位牧师轮流领祷，为抗日战争的胜利、国家的公平公义、南京大屠杀幸存者、世界上仍饱受战争侵扰的人、教会合一等祷告。

此次崇拜特别邀请了原金陵协和神学院新约教授赵志恩牧师，86岁他回忆起了日军对于中国人民的压制。日军侵略浙江湖州期间，在城门口严关卡，要求过往的中国人向日本国旗敬礼。日军还到农村扫荡，抢夺中国老百姓的食物，并曾在赵牧师父亲不愿谈及新四军动向时将其仍入河中，幸好赵父会游泳才逃过一劫。

年幼的赵志恩为了生活，还于12岁时到城里做买卖，学业也因此受到影响，直到20岁才高中毕业，原因之一是迫于生计要出去做小买卖，另一个原因是赵父不愿意自己的儿子到日本人的学校去读书，也不愿意他学日文。

赵牧师说，回顾过往，一切就像昨天发生的一样，希望上帝能伸张正义，也希冀世界和平。

赵志恩牧师讲完自身经历之后，南京教会的李兰成、阚仁平、赵志恩等12位牧师轮流领祷，为抗日战争的胜利、国家的公平公义、南京大屠杀幸存者、世界上仍饱受战争疾病等侵扰的人以及教会合一等祷告。“永活的上帝啊！使我们作和平之子。在憎恨之处播下你的大爱；在伤痛之处播下你的宽恕；在怀疑之处播下你的信心，在绝望之处播下你的盼望，在幽暗之处播下你的光明，在忧伤之处播下你的欢愉。”李兰成牧师带领全体牧师和信徒如此祷告。

此外，张凤莲牧师在证道中还提到了南京大屠杀期间救助中国难民的外国传教士，如贝德士、麦卡伦和约翰马吉等，她希望基督徒能够效法基督，不要仅为自己而活，而是能够帮助那些需要帮助的人。