2010年4月14日早上7时49分，青海省玉树藏族自治州发生7.1级地震，造成重大人员伤亡。北京市基督教两会密切关注玉树地震灾区的情况，向全市广大信徒发出倡议，请弟兄姊妹为地震灾区同胞祷告，并伸出援助之手与灾区人民共渡难关。

2010年4月21日上午10时，北京市基督教两会牧长及全体同工聚集在一起，肃立三分钟，向在青海玉树地震中遇难同胞表示深切哀悼。在巨大的自然灾害面前，北京市基督教两会愿做灾区弟兄姊妹的坚强后盾，与灾区人民携手同心，以实际行动为灾后重建贡献力量。