“百年堂，此系美国南卡罗莱纳省萨姆特城三一堂捐献，所成用作监理公会国外布道百周年纪念。中华民国十年，西历一千九百二十一年敬志。”这是刻在南京百年堂白色黄冈岩碑上的一段话。
据《扬子晚报》报道，与金陵神学院同时落成的百年堂位于汉中路南京医科大学老校园中的江苏省口腔医院大楼后面。1921年，美国南卡罗莱纳州萨姆特城三一堂捐建了这座建筑物，用作监理公会国外布道百年纪念。
在百年堂的东北面约二十米处，还有一幢高三层的西式建筑，风格与百年堂相近，相传是传教士住宅，目前均为南京医科大学办公楼。百年堂和另外那幢楼房风格统一，都建于1921年。2006年，这两幢建筑被列为近现代重要史迹及代表性建筑，成为南京市“文物保护单位”。
当时，从新街口大锏银巷东到南京医科大学老校园，当年都是金陵神学院的范围，可见校区规模之大。鸦片战争后，基督教传入中国，南京成为重要的传教中心。民国时期，基督教所设医院、学校、教堂等数不胜数，南京几乎成为全国基督教的中心。
据南京市民族宗教事务局网站介绍，南京基督新教始于清同治年间。同治六年（1867年），英国内地会传教士童根福同助手天福，从苏州来南京传教。同治十二年（1873年）基督教北长老会韦理牧师来到南京传教，于1874年在四根杆子建立了南京第一座教堂——四根杆子礼拜堂，至今已有140年历史。2013年3月31日，江苏省内目前最现代的大教堂“圣训堂”献堂。南京现有圣训堂、圣保罗堂、莫愁路堂、江苏路堂等16个教堂，247个固定场所。全市有信徒15万人左右，牧师35位，长老20位，神学毕业生61位，义工传道239位。
