在东方之星遇难乘客中，南京乘客多达上百人，社会各界也在密切关注事件进展。面对这场灾难，南京莫愁路堂、江苏路堂等一直在带领会众为此次搜救行动祈祷，6月7日主日礼拜，莫愁路堂为此举行公祷，近2000人共同为事故遇害者祷告。

“莫愁路堂为东方之星沉船搜救工作祈祷”的横幅挂在教堂圣台后墙，主日礼拜证道之后，莫愁路堂主任牧师李兰成带领会众同声诵读印在程序单的祷文，为“东方之星”沉船搜救工作祈祷：

“慈悲全善的上帝，施恩怜悯的救主！你满有恩惠慈爱，眷顾世界，养育万民。你是‘以马内利’，时刻与人同在的神。平安之时主同在，患难之时主仍同在。特别在遭遇天灾人祸陷入患难的人们，你更是赐下安慰与希望，藉着激励人们的善心、爱心实行救助。

我们特别为着6月1号晚间，在长江里突遇龙卷风而沉船的“东方之星”客轮的搜救工作祈祷！这件事牵动着各级政府及许多人的心，也投入了大量的人力资源多方施救，求主祝福施救顺利，克服困难，最大限度地救出伤员。求主安慰那些面临亲人离世的家庭，使离者得安息，生者得安慰，使面临生离死别的家庭家人得安抚。求主祝福一切善后工作顺利平稳，也使更多与此有关的家庭得安慰。”

自救援行动开展以来，除8人仍失踪之外，456人仅有14人生还，其他人全部遇难。获救人员中，一名南京老人朱红美是首位获救游客，她在水里浸泡长达17个小时，最终获救。