江西圣经学校创办于1992年秋季，最早为学制一年的“江西省教牧人员进修班”，1993年4月更名为“江西省基督教圣经学校”。创建伊始，办学条件非常艰苦，可谓从零开始。如今，学校有了固定的办学场所，并于2015年正式升格为大专神学院校。

据悉，创办初期，从1992年秋学期到1996年夏，学校借南昌市基督教志道堂的一间小阁楼作为教室，只能容纳24人就读。省两会的同工就是教师，教牧同工奉献书籍组建了图书室，南昌市志道堂每月最后一周的主日奉献为江西省两会和圣经学校的经费来源。在这种艰苦的办学条件下，培养了四届共98位毕业生。

在全省教会和圣经学校的共同祷告努力下，1996年购买了南昌市郊湾里区一栋三层楼的民房，学校开始有了一个真正独立的校舍，也开始有了专职教师。随着社会与教会发展，一年的学习已不能适应时代和教会的需要，在专职教师队伍逐渐扩大与办学条件相对改善的前提下，学校的改制迫在眉睫，1998年，学校在南昌市青云谱区购买一倒闭村办工厂作为办学校舍，开始招收二年制学生，并招收已毕业的学生回校复读深造，收获很大。1999年秋，学校又迁回湾里租用一破产旧厂房（江西防水材料厂）继续办学。

2001年，经省基督教两会的多方努力，终在南昌市新建县购买一座小山，约21亩，并取名为恩典山。2002年5月奠基开工，2003年9月，教学楼和综合楼落成完工。江西圣经学校结束了四易校址，无固定性办学场所的办学状况，搬入了新址即南昌市新建县文峰路77号恩典山办学，作为圣经学校长期性的办学场所。2004年10月圣经学校学生实习教堂——恩典堂，落成献堂，投入使用，使学生能学以致用，使所学知识有了用武之地，使学校课堂教学与教堂实习紧密相联。

2011年，经国家宗教事务局批准，学校正式纳入全国基督教神学教育体系，定名为“江西圣经学校”，成为学制两年的基督教院校。2012年12月，江西圣经学校在南昌举行了建校二十周年庆典，江西省民宗局副局长王希贤等领导与各地嘉宾、教友代表、学校师生共同参加庆典仪式。庆典结束后，还举行了图书馆奠基典礼。2015年，经国家宗教局批复，江西圣经学校正式升格为大专神学院校，学制三年，并已在2015年9月招收了第一批大专班学员。

江西圣经学校表示，神既已带领江西圣经学校走过了昨天，我们深信今天和明天神会更加倍地赐恩给江西这块红土地，培养更多服务教会的优秀人才。