9月8日莫拉克台风满月，台湾初中小学纷纷开学，有的学校受损严重无法上课，“中华基督教救助协会”即刻采取相应措施，现已完成在台东太麻里乡大王村、大武乡大武村、金峰乡嘉兰村、达仁乡土（土反）村的评估，将在近期内设置移动式儿童课后陪读班。

陪读班由志工（志愿服务工作者）陪伴孩子读书、做功课，协助灾童学习。据台湾“中央社”报道，当地的教会，如达旺浸信会牧师刘正宏等人已表达执行这项计划的高度意愿。

除此之外，为了让受灾学童能在开学后顺利回到校园，基督教救助协会针对嘉兰小学57户房屋被冲走的113名小朋友，赠送全套学生制服，以及由厂商天柏岚与学学文创两家企业捐赠的学习用品，希望孩子在经历人生剧变后，能穿戴一新，带着全新的学习用品，迎接新的开始。

救助协会东区主任娄玉诚表示，这些孩子都是在大水来时仓皇离家，除了身上穿的衣服外，什么也没带。外界虽捐赠许多衣服，但学校制服仍须下山购买，对住在收容中心的家长而言，也是一种负担，因此救协特地为孩子预备全套制服与学习用品。

据台湾媒体报道，莫拉克台风对岛内校园造成重创，全台共346所学校受灾，损失金额在7700万元以上。学校多处淹水，大部分教学设备都泡在水中，校园场地上也到处积有淤泥，还有的学校，新到的下学期课本也被水浸泡，损失严重。